Кто был невоспетым героем, освободившим Морфеуса из Матрицы? Памятно сыгранный Лоуренсом Фишберном, Морфеус - полумифическая фигура бунтаря в цифровом пространстве Матрицы. Нео слышал его имя, которое обсуждали в узком кругу киберпространства, но их личная встреча раскрывает детали, которые он и вообразить себе не мог. Морфеус раскрывает Нео истину мира, предлагая либо красную таблетку реальности, либо синюю таблетку неведения. Киану Ривз проглатывает красную таблетку, позволяя Морфеусу и его команде вырвать физическое тело Нео из человеческой аккумуляторной системы Машин, отсоединив его от симуляции Матрицы и благополучно доставив на борт корабля.
По дороге в Зеон, Нео обучается, загружая в свою память все возможные умения и знаний, одновременно узнавая, что почти каждый человек, живущий в подземном поселении, испытал тот же самый процесс освобождения. Соратники Морфеуса ведут команды на поверхность Земли, рискуя жизнью, ради освобождения людей, чьё сознание начинает подвергать сомнению природу Матрицы. Их текущая миссия состоит в том, чтобы просто освободить как можно больше людей от порабощения, но, как правило, мишенью становятся только молодые, так как сознание взрослых становится слишком индоктринированным, чтобы безопасно освободиться. В дополнение к Нео, Морфеус также освободил Троицу и многих других персонажей от Матрицы, но кто был ответственным за отключение от Матрицы самого Морфеуса?
Морфеус ссылается на своего освободителя в оригинальном фильме "Матрица" 1999 года. Описывая Нео природу Избранного в Матрице, Морфеус говорит, что в далёком прошлом родился человек, который мог изменять Матрицу по своей воли, и утверждает, что "именно этот человек освободил первого из нас". В этой строке использование Морфеусом "нас" может быть обобщённым термином, относящимся к народу Зеона в целом. Но эта фраза может также предполагать, что сам Морфеус был одним из этих первых людей, освобожденных предшественником Нео.
История Морфея противоречит более поздним откровениям, которые приходят благодаря любезности архитектора в фильме "Матрица: Перезагрузка". После того, как Нео, наконец, встречается с создателем Матрицы и его безукоризненно подстриженной бородой, ему говорят, что легенда об Избранном - ложь. Несмотря на то, что говорил Морфеус, каждая реинкарнация Избранного приводит к разрушению Зеона и направляет небольшую группу из 23 выживших, чтобы восстановить подземный город. Легко заметить, как рассказ Архитектора может превратиться в сказку, которую продает Морфеус, но самое главное отличие заключается в том, что ранние поселенцы не были освобождены от Матрицы - они уже были отключены от сети. Неясно, сохраняются ли у 23-х прежние знания о тайне Зеона, или же воспоминания о старом Зеоне исчезают из их воспоминаний.
Объяснение Архитектора оставляет нам два варианта того, как Морфеус был отключен от сети. Если он действительно был частью первоначального населения Зеона, то 23 выжившим, должно быть, промыли мозги, чтобы они поверили, что они были освобождены от Матрицы Избранным. Но если Морфеус использовал "мы" во время вышеупомянутой речи, обращённой к Нео, то он, должно быть, был освобожден персонажем, который не был показан зрителям, через некоторое время после последней перезагрузки симуляции. Последний вариант, более вероятен, так как возраст Морфеуса предполагает, что он не входил в число первоначальных зионцев. Однако, поскольку восприятие времени Зиона сильно искажено, оба варианта остаются вероятными.
Тайна освобождения Морфеуса, наконец, может быть раскрыта в предстоящем фильме - Матрице 4. Ходят слухи, что предстоящее продолжение 2021 года будет включать в себя путешествия во времени, а Яхья Абдул-Матин может сыграть молодого Морфеуса. В комиксах Матрицы говорится о том, что в детстве Морфеус был отключён от сети, а с помощью путешествия во времени, зрители смогут увидеть этот момент на экране впервые.