Де виходить: Nickelodeon
Для якого віку: 10+
Скільки серій в 3 сезоні: 26 серій
Трохи врятувавшись від Шредера та Краанга, черепахи, Ейпріл і Кейсі знайшли притулок у сімейному фермерському будинку Ейпріл на півночі штату, щоб оговтатися та зрозуміти, як зупинити Краанга. Черепахи мають справу з відсутністю Сплінтера та ймовірністю того, що Лео не одужає повністю, а таємнича істота переслідує групу.
Коли Черепахи виявляють бігфута в лісі, Донні подружився з ним і наполягає, щоб вони захистили його від мисливця.
Коли хлопці знаходять корабель Kraang, похований під будинком Ейпріл, вони також знаходять втрачену матір Ейпріл.
Потрапивши в біду через сміття будинку, Мікеланджело засмучується і тікає. Після зустрічі з Наполеоном Бонафрогом, членом Панків-Жаб, він несвідомо приєднується до них у плані захоплення людей і захоплення міста.
Істоти, які харчуються снами, захоплюють черепах у власні сни, а Ейпріл і Кейсі повинні знайти спосіб їх розбудити.
Коли Кейсі та Донателло з’єднуються під час створення нового хот-рода Кейсі, зв’язку кидає виклик мутант-хотродінг.
Коли Кейсі, Раф, Майкі та Донні потрапили в полон до нового мутанта, Ейпріл і Лео повинні подолати інвалідність, щоб врятувати їх.
Лео бере Черепашок тренуватися в лісі в передовому ритуалі ніндзя; Черепахи повинні подолати свої слабкості та протистояти своїм ворогам, щоб стати справжнім ніндзя.
Коли Черепахи повертаються до міста, щоб шукати Сплінтера, вони виявляють, що місто заполонили Краанг.
Поки Черепахи шукають Караї, вони змушені мати справу з містом, наповненим краангдроїдами, а також Зеком і Стеранко.
Донні закінчує нову партію ретро-мутагену в надії врятувати Караї; на Черепах полюють нові поплічники Шреддера, Бібоп і Рокстеді.
Лео підозрює, коли Слеш з’являється на чолі команди під назвою «Могутні Мутанімали»; Черепахи повинні сміливо подолати химерний світ Виміру Х, щоб врятувати поневолених людей Нью-Йорка.
Поки Могутні Мутанімалс облягають TCRI, Черепахи повинні вистояти в химерному світі Виміру X, щоб врятувати поневолених людей Нью-Йорка.
Кейсі Джонс думає, що він сам може впоратися зі злочинним світом, але незабаром виявляє, що він зашкалює.
Новий і незнайомий мутант, відомий як Макман, починає набувати слави як «Герой-монстр» Нью-Йорка.
Шредер викрадає могутніх мутанімалів і експериментує з ними.
Рептилія, яка катається на скейтборді, подружилася з Майкі та Кейсі.
У Караї промивають мізки, і він кидається за черепахами.
Черепах несе крізь час учень Майстра часу Рене, і всі вони повинні працювати разом, щоб перемогти злого Майстра часу Саванті Ромеро.
Коли Черепахи випадково потрапляють у минуле, вони випадково перетинаються зі знайомим кланом ніндзя.
Леонардо вирішує самотужки пробратися до лігва Шреддера та стикається з найбільшою загрозою мутантів.
Після нещасного випадку Донні виявляє, що повільно втрачає розум.
Невідомий ворог заманює Черепах у смертельні пастки.
Раф знаходить нового друга на ім’я Зог, прибульця Трицератона.
Коли черепахи дізнаються про повернення Краанга, вони розуміють, що на Землю нависла ще більша загроза.
Коли черепахи дізнаються про повернення Краанга, вони розуміють, що на Землю нависла ще більша загроза.
