Сколько серий в 6 сезоне: 24 серии
Персоналу «Сиэтл Грейс» приходится иметь дело с последствиями трагической кончины Джорджа. Поскольку эта новость сильно ударила по персоналу, все они должны найти способ пройти через этапы горя. Позже мать Джорджа прибывает в больницу, чтобы решить, что делать с его органами.
Хотя с момента смерти Джорджа прошло много времени, все продолжают бороться с его кончиной, находя отвлекающие факторы, чтобы занять себя. Мередит и Дерек справляются, заключая свой брак везде и всюду, в то время как доктор Вятт предлагает Кристине и Оуэну воздерживаться от секса.
Через несколько недель после того, как ее почти закончился опыт, выздоравливающая Иззи возвращается к работе. Между тем, нервничая по поводу увольнений в больнице после объявления начальника, жители Сиэтл Грейс соревнуются, чтобы пережить сокращения, в том числе Кристина, которая пытается работать вместе с Аризоной в педиатрии. А и без того сложный случай пациентки Бэйли и Алекс еще больше осложняется ее сыном-шизофреником.
Когда отец Мередит и Лекси, Тэтчер, возвращается в больницу с отказом печени, Мередит должна спасти ему жизнь. Тем временем Иззи сочувствует пациентке, изрешеченной опухолями, а Марк, раздраженный соревновательным рвением Кристины, обманом заставляет ее помочь в необычной операции.
Жители Сиэтла Грейс и Мерси Уэст соперничают за операции и свою карьеру, когда начинается первый день слияния больниц. Тем временем Аризона поддерживает разъяренную Кэлли, когда ее отец, мистер Торрес, нанимает священника, чтобы убедить ее встречаться с мужчинами, и Иззи испытывает на себе всю тяжесть своего нового хирургического соревнования.
После того, как жертва ожога неожиданно умирает посреди хаотичного отделения скорой помощи, начальник и член правления Дженнингс допрашивают жителей, чтобы найти виновного, поскольку все жители Mercy West и Seattle Grace защищают свои действия, пытаясь сохранить свои рабочие места.
Когда у Исаака неоперабельная опухоль, обвивающая его позвоночник, он хочет, чтобы Дерек сделал невозможное. Дерек проверяет авторитет шефа, когда Ричард возражает против проведения рискованной операции.
Родители 10-летнего пациента из Аризоны предлагают щедрое пожертвование в размере 25 миллионов долларов Сиэтл Грейс. Она оказывается в конфликте интересов, когда его состояние ухудшается. Кристина проверяет свои границы с Оуэном в больнице. Алекс остается со всеми больничными счетами Иззи, с которыми нужно бороться.
Оуэн нанимает доктора Тедди Альтмана, бывшего иракского ветерана, в качестве нового кардиоторакального хирурга. Кристина сомневается в своих способностях в отделении неотложной помощи и отношениях с Оуэном. Иззи возвращается в Сиэтл Грейс со своим школьным наставником в поисках лечения от слабоумия. Обязанности Ричарда после слияния сказываются на нем.
Когда праздники приходят и уходят, Миранду неожиданно навещает ее отец Уильям, который решительно не одобряет ее выбор в жизни. Марк и Лекси должны справиться с человеком, который снова входит в жизнь Марка, и Тэтчер Грей сомневается в поведении Шефа, но Мередит быстро встает на защиту Шефа.
Чтобы получить помощь в сложной операции на своей беременной дочери, Марк летит с Аддисоном в Сиэтл, в то время как Оуэн ставит под сомнение мотивы Тедди после того, как она поручает Кристине провести сложную операцию. Между тем подозрения Дерека возникают, когда Шеф нанимает Мередит для помощи в громкой операции.
Дерек противостоит Ричарду из-за его алкоголизма, пытаясь помочь своему другу и больнице. Иззи возвращается, чтобы примириться с Алексом, и напряженность между Тедди, Кристиной и Оуэном обостряется.
Дерек вступает в должность временного начальника, поскольку ему предстоит огромный судебный процесс, когда пациент Бейли и Мередет просыпается на столе.
День святого Валентина поражает Сиэтл Грейс на ура, когда рушится крыша популярного романтического ресторана, и врачам приходится иметь дело с осадками. Дерек продолжает бороться на своей новой должности, поскольку его плотный график берет свое, в то время как Мередит сталкивается с давлением, будучи женой вождя. Тем временем Марк и Кэлли пытаются убедить Слоан поступить правильно для своего ребенка.
Дерек восстанавливает больничные лекции, заставляя врачей рассказывать истории из своего прошлого: Бейли рассказывает о своих днях в качестве робкой молодой жительницы, Кэлли размышляет о случае полиомиелита, а Ричард вспоминает пациента со СПИДом, которого он лечил вместе с Эллисом.
Когда известного хирурга доктора Харпера Эйвери срочно доставили в Сиэтл Грейс-Мерси-Уэст, сотрудники с удивлением обнаруживают, что один из них связан с этой легендой, а его неортодоксальная просьба об операции вызывает напряженность между Дереком и Ричардом. Тем временем Кэлли и Аризона пытаются помочь Тедди и Слоану уйти от своего прошлого и найти более зеленое пастбище.
В больницу прибывает пациент, нуждающийся в сложной хирургической процедуре, и Ричард приходит в ярость, когда Дерек выбирает Оуэна, чтобы сделать это вместо него. Тем временем Бейли нервно готовится к другому свиданию с Беном.
Когда пациентка Тедди хочет прекратить лечение и свою жизнь, она обращается за помощью к Ханту. Ситуация вызывает воспоминания Ханта о его жизни на войне и его прошлых отношениях с Тедди. Тем временем Кэлли и Аризона расходятся во мнениях относительно своего будущего, и Ричард пытается приспособиться к своей роли хирурга.
Когда брат Алекса оказывается в больнице с грыжей, Алекс должен получить одобрение Бейли на бесплатную операцию; части прошлого Алекса раскрываются его друзьям и коллегам.
Слоан рожает, и Марк, Тедди, Кэлли и Аризона приходят ей на помощь. Врачи столкнулись со случаем, когда капитан лодки с крабами попался на крючок гигантской акулы.
Бэйли готовит команду к обязательному обучению чувствительности перед приемом пациента весом 700 фунтов со сложными медицинскими проблемами, и случай оказывается сложным во всех смыслах этого слова. Тем временем Дереку приходится столкнуться лицом к лицу с мужем бывшей пациентки в неправомерном даче показаний, а время, проведенное с дочерью больного сердцем, открывает для Кристины старые раны.
Пожилой пациент, поступивший в отделение неотложной помощи по поводу сердечного приступа, видит знакомое лицо, давно потерянную любовь, которая также оказывается в отделении неотложной помощи из-за перелома руки, и персонал оказывается вовлеченным в историю своей любви. Тем временем Карев лечит проблемную пациентку-подростка Хейли, чьи родители привезли ее из-за шизофрении, и Мередит не может не рассказать Кристине о своих подозрениях в отношении Оуэна, что неизбежно приводит к путанице в голове Кристины.
В первый час двухчасового финала шестого сезона больница «Сиэтл Грейс» переживает небывалый кризис в своей истории. В финале сезона Сиэтл Грейс будет наводнен жертвами наезда нескольких автомобилей. Один из врачей также будет опустошен пожаром в ее доме.
На втором часу финала сезона хирургические поцелуи Кристины и Мередит подвергаются окончательному испытанию.
