Скільки серій в 6 сезоні: 24 серії
Співробітникам Seattle Grace доводиться впоратися з наслідками трагічної смерті Джорджа. Оскільки ця новина сильно вразила персонал, вони всі повинні знайти спосіб пройти через етапи горя. Пізніше мати Джорджа приїжджає в лікарню, щоб вирішити, що робити з його органами.
Хоча з моменту смерті Джорджа минув час, усі продовжують боротися з його смертю, знаходячи відволікання, щоб зайняти себе. Мередіт і Дерек справляються з цим, укладаючи свій шлюб будь-де і всюди, тоді як доктор Вятт пропонує Крістіні та Оуену утриматися від сексу.
Через кілька тижнів після того, як вона майже минула, Іззі повертається до роботи. Тим часом, хвилюючись через те, що в лікарні будуть звільнені після оголошення начальника, жителі Сіетл Грейс змагаються, щоб вижити через скорочення, включаючи Крістіну, яка намагається працювати разом з Арізоною в педіатрії. І без того складний випадок пацієнтки Бейлі та Алекса ще більше ускладнюється її сином, хворим на шизофренію.
Коли батько Мередіт і Лексі, Тетчер, повертається до лікарні з відмовою печінки, Мередіт повинна врятувати йому життя. Тим часом Іззі співпереживає пацієнтці, ураженій пухлинами, а Марк, роздратований змагальним запалом Крістіни, обманом змушує її допомогти з незвичайною операцією.
Мешканці Сіетл Грейс і Мерсі Вест змагаються за операції та кар’єру, коли починається перший день злиття лікарень. Тим часом Арізона підтримує розлючену Каллі, коли її батько, містер Торрес, наймає священика, щоб він переконав її зустрічатися з чоловіками, а Іззі відчуває тягар свого нового хірургічного змагання.
Після того, як постраждалий від опіків несподівано помирає серед хаосу швидкої допомоги, начальник і член правління Дженнінгс допитують мешканців, щоб знайти винного, оскільки всі жителі Мерсі-Вест і Сіетл Грейс захищають свої дії, намагаючись врятувати свої робочі місця.
Коли в Айзека неоперабельна пухлина огорнула хребет, він хоче, щоб Дерек зробив неможливе. Дерек перевіряє авторитет шефа, коли Річард заперечує проти ризикованої операції.
Батьки 10-річного пацієнта з Аризони пропонують щедру пожертву в розмірі 25 мільйонів Сіетл Грейс, коли її стан погіршується. Крістіна перевіряє свої межі з Оуеном у лікарні. Алексу доводиться сплачувати всі лікарняні рахунки Іззі.
Оуен залучає доктора Тедді Альтмана, колишнього ветерана Іраку, як нового кардіоторакального хірурга, Крістіна ставить під сумнів свої здібності у відділенні швидкої допомоги та стосунки з Оуеном. Іззі повертається до Сіетл Грейс зі своїм шкільним наставником у пошуках лікування від деменції. Обов'язки Річарда після злиття лягають на нього.
Свята приходять і йдуть, а Міранду несподівано відвідує її батько Вільям, який різко не схвалює її життєвий вибір. Марк і Лексі повинні впоратися з людиною, яка знову входить у життя Марка, і Тетчер Грей сумнівається в поведінці вождя, але Мередіт швидко стає на захист вождя.
Щоб отримати допомогу з важкою операцією на своїй вагітній дочці, Марк відправляє Еддісон до Сіетла, а Оуен ставить під сумнів мотиви Тедді після того, як вона доручила Крістіні вести складну операцію. Тим часом у Дерека виникають підозри, коли начальник залучає Мередіт для допомоги в масштабній операції.
Дерек стикається з Річардом через його алкоголізм, намагаючись допомогти своєму другові та лікарні. Іззі повертається, щоб помиритися з Алексом, і напруга між Тедді, Крістіною та Оуеном загострюється.
Дерек вступає на посаду тимчасового начальника, оскільки йому загрожує величезний судовий позов, коли пацієнтка Бейлі та Мередет прокидається на столі.
День Святого Валентина вразив Сіетл Грейс з тріском, коли дах популярного романтичного ресторану руйнується, і лікарям доводиться боротися з наслідками. Дерек продовжує боротися на своїй новій посаді, оскільки його зайнятість бере своє, а Мередіт стикається з тиском бути дружиною вождя. Тим часом Марк і Келлі намагаються переконати Слоан вчинити правильно для її дитини.
Дерек відновлює лікарняні лекції, спонукаючи лікарів розповідати історії свого минулого: Бейлі розповідає про свої дні, коли вона була боязкою молодою лікаркою, Каллі розмірковує про випадок поліомієліту, а Річард згадує хворого на СНІД, якого він лікував з Елліс.
Коли відомого хірурга доктора Гарпер Ейвері терміново відправляють до Сіетла Грейс-Мерсі Вест, співробітники з подивом виявляють, що один із них має відношення до цієї легенди, і його незвичайне прохання про його операцію викликає напругу між Дереком і Річардом. Тим часом Каллі та Аризона намагаються допомогти Тедді та Слоан позбутися свого минулого та знайти зеленіші пасовища.
До лікарні прибуває пацієнт, який потребує складної хірургічної процедури, і Річард розлючений, коли Дерек обирає Оуена, щоб зробити це замість нього. Тим часом Бейлі нервово готується до нового побачення з Беном.
Коли пацієнтка Тедді намагається припинити лікування та припинити своє життя, вона звертається за допомогою до Ханта. Ситуація викликає у Ханта спогади про його життя на війні та його минулі стосунки з Тедді. Тим часом Каллі та Аризона розходяться в думках щодо їхнього майбутнього, і Річард намагається звикнути до своєї ролі хірурга.
Коли брат Алекса з'являється в лікарні з грижею, Алекс повинен отримати схвалення Бейлі на безкоштовну операцію; частини минулого Алекса відкриваються його друзям і колегам.
У Слоан пологи, і Марк, Тедді, Каллі та Аризона приходять на допомогу. Лікарі зіткнулися з випадком капітана крабового судна, якого обняли гігантським гачком для акули.
Бейлі готує команду до обов’язкового тренування чутливості перед прийомом 700-фунтового пацієнта зі складними медичними проблемами, і випадок виявляється складним у всіх сенсах цього слова. Тим часом Дереку доводиться зіткнутися віч-на-віч з чоловіком колишньої пацієнтки, який дає протиправні показання, а проведення часу з дочкою хворого на серце відкриває для Крістіни деякі старі рани.
Літній пацієнт, якого госпіталізували у відділення невідкладної допомоги через хворобу серця, бачить знайоме обличчя, давно втрачене кохання, яке випадково перебуває у відділенні невідкладної допомоги через перелом руки, і персонал опиняється втягнутим у історію їхнього кохання. Тим часом Карев лікує проблемну пацієнтку-підлітка Гейлі, яку батьки привели до неї через шизофренію, і Мередіт не може не розповісти Крістіні про свої підозри щодо Оуена, що неминуче псує голову Крістіни.
У першу годину двогодинного фіналу шостого сезону лікарня «Сіетл Грейс» переживає кризу, як ніколи в історії. У фіналі сезону Сіетл Грейс буде завалений жертвами зіткнення кількох автомобілів. Одна з лікарів також постраждає від пожежі у своєму будинку.
На другій годині фіналу сезону хірургічні обійми Крістіни та Мередіт піддаються найвищому випробуванню.
