Где выходит: Cartoon Network
Сколько серий в 13 сезоне: 16 серий
Ниндзя приглашены на вечеринку по случаю дня рождения принцессы Вани в Королевстве Синтаро. Они приводят с собой Мастера Ву, который чувствует свой возраст.
Принцесса Ваня открывает секретный вход, ведущий в подземную шахту под Синтаро, где хранятся темные тайны города.
Ниндзя пытаются спасти Коула, но ссоры его товарищей по заключению предупреждают Колдуна Черепа, и вскоре ниндзя тоже становятся пленниками.
Чтобы сбежать от цепной банды Чародея-Черепа, ниндзя должен убедить Мансов и Геклов отбросить недоверие и работать вместе.
Отделившись от остальных, Ния, Джей и Ллойд уводятся обратно в «домашнюю пещеру» Манса по имени Мурт.
Кай и Зейн натыкаются на группу геккелей, которые думают, что могут работать на Колдуна-Черепа.
Коул сначала бежит в гнездо Люто-Летучих Мышей, а затем в пещерный туннель, наполненный гигантскими пауками, но принцесса Ваня и ее домашний дракон Чомпи прибывают как раз вовремя, чтобы освободить Коула.
Принцесса Ваня пытается поймать падающих Мастера Ву и Коула, но их общий вес вырывает ей крылья. Все трое друзей ныряют в гору.
Коул просыпается от сна и обнаруживает, что его окружают Скромные, Мастер Ву и принцесса Ваня.
Коул возглавляет Скромных, Принцессу Ваню и Мастера Ву в серии бесплодных попыток найти выход из неизбежного Каменного Дна.
Ния использует свои силы стихий, чтобы заставить Мансов согласиться на перемирие с Геклами.
Коул, Принцесса Ваня, Мастер Ву и Скромный прибывают в древний заброшенный храм. Ву понимает, что это Сердце Горы.
Колдун-Череп выслеживает ниндзя, которые бегут в «Сильную Пещеру» Геклов. Колдун-Череп обещает оставить Мансов и Геклов в живых, если они выдадут ниндзя.
Коул, Скромный, принцесса Ваня и Ву узнают, что каменный робот питается энергией элементаля Земли, и используют ее, чтобы выбраться из горы.
Коул и Аппли прибывают в Крепость Чародея Черепа и находят ниндзя, запертых в клетках. Геклы и Мансы снова вернулись к работе в цепной банде, добывающей Венджестоун.
Пока Коул и Колдун-Череп сталкиваются друг с другом, Геклы и Мансы штурмуют крепость. Пландар освобождает ниндзя из клеток, и ниндзя присоединяются к битве.
