Где выходит: FOX
Для какого возраста: 15+
Сколько серий в 3 сезоне: 13 серий
В начале сезона Майкл Скофилд находится в Соне, адской и смертоносной панамской тюрьме, где предыдущий бунт вытеснил всю власть и оставил заключенных самим распоряжаться своей жизнью (и смертью). Судьба его близких висит на волоске, и Майкл должен найти Уистлера, загадочного сокамерника, скрывающегося в канализационной системе тюрьмы, чтобы вырвать его из тюрьмы, из которой нет выхода. Тем временем Линкольн ищет пропавшую Сару и получает тревожные новости об Элджее.
После того, как Майкл получает плохие новости от Линка, он отправляется на поиски заключенного по имени Уистлер, у которого есть ключ к его свободе. Это легче сказать, чем сделать: Уистлер прячется в Соне, потому что за его голову назначена цена, а Лечеро не собирается помогать Майклу его найти. Кроме того, и Махоуни, и Беллик тоже хотят добраться до Уистлера. Между тем, Ти-Бэг не позволит небольшому унижению помешать ему втереться в расположение Лечеро.
Кто-то подсовывает конверт с фотографией Сары и Эл-Джея под дверь гостиничного номера Линка. В нем могут содержаться подсказки об их местонахождении. Сотрудник компании в Панама-сити тоже может помочь, но Линк должен убедить ее, что это в ее интересах. А в Соне Майкл знакомится с Уистлером; Лечеро начинает терять уверенность в своей способности формировать события; и Махоуни, который все больше нуждается в лекарствах, встречает адвоката, который будет его защищать.
Получив посылку от Компании, Линкольн понимает, что они совершенно серьезны. Новый план побега Майкла основан на электричестве. Haywire восстал из мертвых, преследуя дезориентированного Махоуни. Беллик и Ти-Бэг получают особое внимание от Лечеро.
В Сону входит новый сокамерник, что нервирует Уистлера и вызывает подозрения у Майкла; Линк планирует отпуск у океана с Софией, пока Сьюзен сдвигает график побега; Ти-Бэг искушает свою судьбу своим последним аттракционом; и Сукре пытается передать товар Соне.
Уистлер становится главным подозреваемым, когда заключенного находят обнимающим, и Майклу остается доказывать свою невиновность. Майкл также хочет доказать, что Сара все еще жива, иначе он откажется помочь Уистлеру сбежать. Тем временем Линк и София наблюдают за распорядком утренней стражи, а Махоуни получает предложение вытащить его из Соны.
Все идет не так для Майкла, когда он пытается отвлечь внимание. Линкольн пытается перехитрить Сьюзен, у которой есть его сын. Сукре предлагает свою помощь Линкольну.
Сьюзен подвергает опасности жизнь Майкла, поскольку она приводит в действие свой собственный план побега. Прошлое Уистлера настигает его девушку. Компания преследует Линкольна и Сукре. Справедливость восторжествовала над Махоуни. И Лечеро проливает свет в пустой туннель.
Майкл надеется найти выход из одиночной камеры, в то время как Беллик попадает в беду из-за отказа убрать беспорядок. Тем временем Сьюзен Б. настроила свои сайты на Сукре, когда он доставляет Соне. София противостоит Ти-Бэгу после того, как он делает предложение Уистлеру. Также загадочная американка прибыла в Панаму в поисках Майкла.
Битва за контроль над Соной между Лечеро и Сэмми доходит до кипения, когда Ти-Бэг снова привлекает Беллика, чтобы он продемонстрировал свои боевые навыки. Тем временем Майкл возвращается, чтобы укрепить эвакуационный туннель, а в Панама-Сити Линк проводит обыск «Гэри Миллера», в то время как Сукре и Сьюзен Б. проводят пару встреч.
Лечеро, Уистлер, Махоуни, Беллик и Ти-Бэг решают последовать за Майклом, когда он снова начинает выходить из Соны, но работа в команде может быть проблемой. Линк и Сукре помогают, когда погода в последний момент меняет их планы. Вернувшись в Панама-Сити, Сьюзен Б. угрожает Сукре самым худшим из того, что можно себе представить. Она также жаждет снова увидеть Софию.
Беглецы добиваются успеха в своих попытках для некоторых, если не для всех, и им помогает неожиданный источник. Но ошибка обнаруживает, что один беглец что-то оставил.
Майкл и Линк встречаются со Сьюзен Б., когда они направляются в Панама-Сити, за исключением Уистлера. Тем временем Махоуни ждет встречи в кантине Панама-Сити, в то время как на пути из страны установлен блокпост, который останавливает МакГрэйди и его отца. Вернувшись в Сону, Сукре платит за попытку побега, а Ти-Бэг помогает Лечеро осматривать новый пейзаж за стенами.
