Где выходит: Cartoon Network
Для какого возраста: 7+
Сколько серий в 3 сезоне: 26 серий
Ковчег возвращается на Кибертрон, а автоботы на борту не сообщают о явной активности десептиконов. Тем временем на самом Кибертроне Хромия и еще один автобот, Персептор, вырываются из плена, чтобы попытаться предупредить своих товарищей о мимолетной ловушке десептиконов. К сожалению, они снова пойманы, и Хромия вынужден смотреть, как Шоквейв уничтожает Ковчег своим последним изобретением, лазерной ловушкой.
Десептиконы упиваются своей очевидной победой, пока автоботы не обнаруживают себя, а Оптимус ранее заподозрил их ловушку и приказал эвакуировать команду корабля. Между обеими сторонами происходит крупномасштабная битва: Проул наносит смертельный удар из Shadow Striker, предназначенного для Оптимуса, в то время как Шоквейв и Мегатрон инициируют секретный план.
По мере того, как битва продолжается, Бамблби, Хот Род и Читор направляются к Колодцу AllSpark, в то время как Хот Род имеет дело с Дрифтом, который показывает, что инсценировал свой переход на сторону автоботов. Тем временем Уилджек отправляет Вектор Сигму в Непространство, а Виндблейд вовлекает Дубинку в финальную дуэль, которая заканчивается тем, что она также отправляет Десептикона в Непространство.
У Колодца AllSpark Бамблби и Читор вступают в бой с Шоквейвом и побеждают его. Однако, когда AllSpark помещается обратно в свой колодец, Шоквейв посылает свою искру в AllSpark, чтобы испортить его, и впоследствии умирает. В ответ на действия Шоквейва Читор посылает свою собственную искру в артефакт, чтобы обратить вспять его порчу и полностью оживить Кибертрон, жертвуя собой в процессе. Оптимус отправляет Мегатрона в рой Scraplets, добиваясь полной победы автоботов и заканчивая войну.
И автоботы, и десептиконы застряли в бесконечном параде. Хот Род, который не попал в петлю, и Клоббер, которого спас из нее первый, пытаются взломать ее, чтобы освободить своих собратьев-кибертронцев. Попытка терпит неудачу, и обоих преследуют таинственные солдаты с щупальцами, а Клоббер снова схвачен и дважды нуждается в помощи Хот Рода. Двое позже заманивают отряд солдат с щупальцами, прежде чем раздавить их обломками заброшенного здания. Позже они присоединяются к Перцептору, который показывает, что петля, которую в настоящее время испытывают другие кибертронцы, медленно истощает их искры. Имея это в виду, Хот Род решает освободить всех от петли и положить конец вторжению на их родную планету.
Клоббер, снова взламывая петлю, безуспешно пытается предупредить некоторых кибертронцев выйти из петли. Однако из него вырывается другой десептикон, Тупик. Исследуя реальную комнату и то, что его товарищи-десептиконы также попали в петлю, Тупик вынужден бежать, когда он случайно предупреждает захватчиков, Квинтессонов. Найдя Клоббера и Хот Рода в одной из старых лабораторий Шоквейва, он нападает на последнюю, предположив, что автоботы несут ответственность за доставку Квинтессонов на Кибертрон. Несмотря на то, что Хот Род объясняет все (также упоминая, как он избежал захвата и что он нашел Персептора, который освободился от петли намного раньше), Тупик остается неубежденным, пока Квинтессоны и их войска, Прокуроры, не находят трех кибертронцев и преследуют их. Только когда троица прячется в баре Маккадама, они могут избавиться от преследователей.
Хот Род снова взламывает петлю, пытаясь освободить от нее Оптимуса Прайма. Несмотря на свои усилия, он не может освободить лидера автоботов, особенно когда его действия встречают сопротивление со стороны тех, кто наслаждается петлей парада. Хот Рода в конце концов ловят Квинтессоны, но его спасают Клоббер, который заметил отсутствие Хот Рода в баре Маккадама, и Вихрь, которому удалось вырваться из петли, пока Хот Род пытался спасти Оптимуса. Тем временем Персептор исследует бар Маккадама, чтобы выяснить, почему Квинтессоны не напали на них, когда они вошли, и обнаруживает, что это на самом деле часть Титана, в котором они прятались все время.
Перцептор объясняет свое открытие, но Хот Род заявляет, что Титан по имени Иаконус не активен и, следовательно, не может им помочь. Когда он, Клоббер, Тупик и Вихрь углубляются в Иаконус, чтобы получить маскирующее устройство, которое защитило их от Квинтессонов, все четверо попадают в тренировочный симулятор. Персептор снова встречается с четырьмя кибертронцами, обезглавив руку, а также обнаруживает внутреннюю работу Иакона. Затем на группу нападает бот-крокодил, от которого они отбиваются. Когда пятеро приближаются к маскирующему устройству, появляется Маккадам и отговаривает их брать устройство, прежде чем объяснить историю Иакона. Вернувшись на поверхность, Хот Род позже решает разбудить Иакона, чтобы остановить Квинтессонов.
В то время как Персептор приходит к выводу, что только Говорящий с городом может разбудить Иаконуса, Хот Род возглавляет команду, чтобы освободить больше своих товарищей из петли парада Квинтессонов. Однако Квинтессоны обнаруживают команду сопротивления Хот Рода, захватывая Хот Рода в процессе. Тем временем Вихрь непреднамеренно освобождает Саундвейва из петли, когда он смещает прикрепленное к нему оборудование, хотя Саундвейв в настоящее время находится в плохом состоянии. Тем временем Хот Род предстает перед судьей Квинтессоном, который объясняет, что они путешествуют по разным вселенным, чтобы судить, достойны ли они. Судья считает Хот Рода виновным, но Хот Род убегает, а Вихрь приходит ему на помощь, после чего Хот Род благодарит Вихря, которого затем «благодарит» Саундвейв.
Несмотря на совместную работу, автоботы и десептиконы по-прежнему не ладят друг с другом. Саундвейв и Хот Род спорят о том, кто должен возглавить кибертронское сопротивление, хотя Саундвейв все еще время от времени замирает в результате того, что его силой вырывают из петли. Даже когда их команда отправляется сражаться с отрядом Квинтессонов, у Хот Рода и Саундвейва все еще разные представления о том, как вести. Во время боя Саундвейв снова замирает, заставляя сопротивление прийти ему на помощь, во время которого они также приводят Шарктикона, работающего на Квинтессонов в качестве их судебного пристава. Позже Хот Род допрашивает судебного пристава Sharkticon, который упоминает ученого. Хот Род спрашивает его, где они могут найти этого ученого.
Хот Род и Саундвейв отправляются обратно в комнату, где содержатся другие кибертронцы, чтобы противостоять Ученому Квинтессону. Ученый игнорирует угрозы Хот Рода, объясняя это тем, что он делал дубликаты Саундвейва из каждой вселенной. Когда настоящий Саундвейв снова замерзает, Ученый исправляет его только для того, чтобы этот Саундвейв выстрелил в него после полного ремонта. Затем Хот Род и настоящий Саундвейв пытаются освободить всех от петли, но сталкиваются с несколькими дубликатами Ученого. В ответ Саундвейв отправляет одного из своих кассетных миньонов, Лазербика, помочь другим кибертронцам проникнуть внутрь и освободить всех автоботов и десептиконов из петли. К сожалению, башня и корабль Квинтессонов объединяются и создают силовое поле...
Автоботы и десептиконы объединяются в последней отчаянной попытке спасти вселенную от Квинтессонов.
Старскрим, используя свои новые способности Квинтессона, полученные в результате встречи с ними, выводит Трансформеров из строя, срывая любые планы побега, которые они приводят в действие. Пока он судит некоторых Трансформеров, Оптимус, Бамблби и раненый Уилджек убегают в мультивселенную. Тем временем Виндблейд направляется к Маккадаму, отбивается от Квинтессонов Шарктиконов и полностью пробуждает Иаконуса с помощью Маккадама. В ответ Старскрим вызывает Кроатона с промытыми мозгами, чтобы тот напал на Иаконуса.
В разгар битвы Маккадам освобождает пленников, прежде чем его сносит случайный взрыв Кротона. Затем Старскрим использует Непространство, чтобы обезглавить Иаконуса, и отправляет Кроатона разрушить город Иакон. Оптимус, Бамблби и Уилджек возвращаются из мультивселенной и противостоят Ученому-Квинтессону, при этом Уилджек находит настоящее тело Ученого и обнимает его, прежде чем Старскрим атакует команду Оптимуса.
Пока Старскрим готовится обнять всех Трансформеров, Мегатрон возвращается из мультивселенной с Тупиком, недавно завербованными инсектиконами и шаттлом десептиконов по имени Астротрейн, чтобы помочь всем, используя его недавно обретенные мультивселенные способности. Windblade освобождает Кроатон от контроля Квинтессонов, но напряжение задачи фрагментирует ее сознание, которое рассеивается по всему Кибертрону.
Мегатрон сообщает Оптимусу, что он получил еще одну Матрицу лидерства из мультивселенной. Используя объединенную силу своих Матриц, Оптимус и Мегатрон навсегда уничтожают Старскрима. После битвы Мегатрон приказывает прекратить огонь и что десептиконы и автоботы будут владеть по половине Кибертрона каждый.
Пытаясь найти пропавший Windblade, Бамблби отправляется на шпионскую миссию на территорию десептиконов.
В поисках Виндблейда Бамблби и Хромия открывают секреты, спрятанные в легендарном Хрустальном городе.
Забытый автобот возвращается на Кибертрон в поисках мести.
Чтобы помочь Виндблейду, Бамблби должен отправиться на запретную луну Кибертрона.
Поиски Windblade продолжаются, когда Гримлок присоединяется к Бамблби в путешествии на доисторический Кибертрон.
Спасательная миссия по спасению Jetfire раскрывает секретную операцию десептиконов.
Поиски Бамблби и Хромии Виндблейда приводят их в газообразное Аргоновое море Кибертрона.
Оптимус Прайм возглавляет ударную группу автоботов, выполняющую миссию вглубь территории десептиконов по уничтожению опасного артефакта.
В финале сериала автоботы и десептиконы сталкиваются с Другим, могущественной версией Мегатрона из альтернативной вселенной.
