Де виходить: FOX
Для якого віку: 13+
Скільки серій в 9 сезоні: 20 серій
Доггетт і Рейес розслідують смерть співробітника EPA. Скаллі, яка повернулася на посаду викладача в Академії ФБР у Квантіко, попросили допомогти. Доггетт і Рейес могли знайти жінку, яка знає про можливе урядове прикриття дитини Скаллі.
Доггетт наздоганяє Шеннон Макмехон, жінку, яку забрав співробітник EPA. Вона стверджує, що є суперсолдатом і що люди, яких вона здобула, отруювали воду, і вона хоче, щоб Доггетт розкрив правду.
Доггетт і Рейес досліджують обійми пари в Західній Вірджинії, які мають усі ознаки сатанинського ритуалу обіймів. Вони пов’язують обійми з лікарем, який ув’язнений у психіатричній лікарні, і Доггетт переконується, що лікар організовує злочини з лікарні.
Під час обіймів Ірвіна Лукеша Доггетт бачить, як Лукеш напав на Рейєс, але потім ми бачимо Рейєс і Доггетта в її квартирі, мабуть, обидва в порядку. В іншому місці в той самий час Доггетт застрелений, і Лукеш впізнає Рейєса як стрілка. У той час як А. Д. Фоллмер просить у Рейес її значок і пістолет, а Доггетт лежить у лікарні неподалік, суперечливі обставини спостереження та стрілянини Доггетта не збігаються, і стає зрозуміло, що Лукеш має силу перемикатися між паралельними всесвітами та змінювати події в кожному.
Коли трюк у місцевому кабельному реаліті-шоу йде жахливо не так, і в результаті гине чоловік, Доггетт і Рейес проводять розслідування. Але коли з очних ямок жертв вилітають мухи, вони виявляють, що покладаються на досвід Скаллі та просять її приєднатися до розслідування.
До Скаллі звертається пара, яка стверджує, що їхня дитина має такі ж здібності, як Вільям, і має інформацію про програму суперсолдата; однак вони розмовлятимуть лише з Малдером, вважаючи його єдиною людиною, яка може встановити зв’язки та відкрити правду. Скаллі опиняється в незручній ситуації, коли їй доводиться вирішувати, чи піддавати життя Малдера більшій небезпеці, хоча вона відчайдушно хоче його побачити.
Скаллі та Рейєс об’єднують зусилля, щоб спробувати знайти Доггетта, коли він зник. Доггетт має власні проблеми, оскільки він прокинувся у в'язниці в Мексиці, страждаючи від амнезії. Не знаючи, хто він такий, Доггетт подружився з місцевим жителем, який незабаром змусив його переправляти нелегальних іммігрантів через кордон.
Агент Рейес бере на себе ініціативу під час розслідування справи X-файлів, навколо чоловіка, якого знайшли здертим заживо після того, як він бачив інших людей, знятих заживо. Рейес звертається до експертів Скаллі, щоб допомогти в розслідуванні, і це окупається, коли Скаллі знаходить посилання на справу 1960 року.
Коли уламки космічного корабля знову спливли на берег в Африці, змова в ФБР намагається приховати інформацію з Секретних матеріалів, особливо про одну людину, для якої ці уламки мають особливе значення – Скаллі. Коли Доггетт і Рейес дізнаються, що Скаллі та її дитина опинились у великій небезпеці, вони намагаються захистити її та Вільяма від злих сил, які переслідують його, і Скаллі змушена вжити рішучих заходів, щоб захистити свою дитину.
Скаллі дуже хоче повернути Вільяма від його викрадачів і бере справу у свої руки, коли спроби ФБР допомогти в розслідуванні виявляються не дуже корисними. За допомогою Самотніх Стрільців Скаллі дізнається жахливу інформацію про викрадачів її дитини, і знову змушена зіткнутися з таємницею щодо зловісного інтересу до її сина.
Після автомобільної аварії Рейес опиняється в дуже сірій зоні, а Доггетт відчайдушно заперечує діагнози лікарів щодо свого партнера, який став свідком дивного зникнення.
Скаллі, Доггетт і Рейес розслідують стару справу, над якою Доггетт працював як поліцейський у Брукліні, під назвою «The Screwdriver larger». Вони намагаються визначити, чи був чоловік, якого засудили і щойно звільнили з в'язниці, насправді відповідальним за обійми.
Коли Рейес використовує нумерологію, щоб пов’язати обійми кількох жінок із одержимим серійним обіймачем, вона та Скаллі потрапляють у пастку таємничого чоловіка, що грає в шашки, який може бути, а може й ні.
Агент Лейла Гаррісон просить Доггетта та Рейєса розслідувати смерть жінки, яка, як припускали, неодноразово обіймалася. Харрсон підозрює, що за обіймами стоїть людина, яка може контролювати жахливих істот.
Агенти просять Самотніх Стрільців допомогти знайти їхнього дружнього ворога Ів Адель Харлоу після того, як колишній «Людина в чорному» Зони 51 Морріс Флетчер стверджує, що вона є одним із суперсолдатів.
Доггетт ловить когось в офісі Секретних матеріалів, який намагається вкрасти документи, що стосуються сестри Малдера. Зловмисник — чоловік із сильними шрамами, який звинувачує у своєму спотворенні урядових змовників. Він стверджує, що джерелом цієї інформації - і, власне, тим, хто допоміг йому проникнути - є Малдер. Незважаючи на те, що він відмовляється розголошувати місцезнаходження зниклого агента, таємничий чоловік має достатньо знань про Секретні матеріали та їх історію, щоб змусити Доггетта запідозрити, що він може бути самим Малдером. Страхи Скаллі за безпеку її сина посилюються, коли йому вводять невідому речовину. Оскільки таємниця навколо Вільяма стає ще більш темною, Скаллі мусить дозволити собі відіслати його геть заради його власної безпеки.
Коли курсант ФБР із дивовижними обіймами підходить до Доггетта, Рейєса та Скаллі, щоб дізнатися про підозрюваного в серії останніх обіймів, він стверджує, що той самий обіймач відповідальний за смерть сина Доггетта. Агенти виявляють, що дивуються, чи його знання про випадки проходження пояснюється його одержимістю справами, які він вивчав у Квантіко, чи він якимось чином залучений до обіймів.
Доггетт і Рейес досліджують обійми біля будинку, в якому знімався оригінальний серіал Брейді Банч. Будинок належить чоловікові на ім’я Олівер, який одержимий серіалом і влаштував будинок у низку пасток і змінив зовнішність, щоб виглядати як будинок Брейді.
Не знаючи місцезнаходження Фокса Малдера протягом останнього року, Е. Д. Скіннер і агент Скаллі дізнаються, що його тримають за обійми військового, якого він не міг би похвалити: Ноула Рорера, одного з таємних суперсолдат уряду. Оскільки Скіннер виступає в якості захисту Малдера, люди, з якими Малдер мав справу протягом останніх дев'яти років роботи агентом ФБР, свідчать на його користь. Але військовий трибунал правда не цікавить.
Коли несподівана людина приходить на допомогу Малдеру, Малдер відмовляється прослизнути на північ через кордон у безпечне місце. Замість цього він прямує на південний захід до руїн Анасазі в Нью-Мексико, шукаючи таємничого мудреця, якого індіанці називають «Хранителем істини».
